تُعنى أمانة الشؤون العلمية بتنظيم العملية الأكاديمية من خطط دراسية ومناهج وجداول ولجان امتحانات، ومتابعة أداء الأقسام العلمية وضمان جودة العملية التعليمية وفق اللوائح المعتمدة.